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Laureato in Medicina con lode nel 2000 e specializzato in Nefrologia nel 2005 presso l’Università di Parma, Augusto Vaglio è stato post-doctoral fellow presso la Emory University di Atlanta, USA, nel 2005-2006. Nel 2009 ottiene il dottorato in Nefrologia presso l’Università di Parma. Dal 2010 al 2018 lavora come nefrologo presso l'Azienda Ospedaliero Universitaria di Parma. Nel 2018 è nominato Professore Associato di Nefrologia presso l’Università di Firenze. Dal 2020 è Direttore della Scuola di Specializzazione in Nefrologia dell'Università di Firenze. La sua attività di ricerca si è concentrata sulle patologie autoimmuni sistemiche, tra cui la sindrome di Churg-Strauss o EGPA. Fa parte del comitato scientifico dell’European Vasculitis Society (EUVAS) e dell’European Vasculitis Genetics Consortium (EVGC). È coordinatore dello European EGPA Study Group.

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